先比对 DOI，再比对标题，与已有条目核对；若匹配就合并两条记录，并保留元数据最完整的版本。这两项检查能发现大多数重复：DOI 会解析到为所标识对象提供的当前信息，标题则能发现未保存 DOI 的条目。
- 查找 DOI。 打开论文的落地页，按原样复制 DOI。DOI 名称通过 Handle System 解析到为所标识对象提供的当前信息，通常是注册机构维护的落地页，因此落地页是确认 DOI 指向哪条记录的地方。
- 在文库中搜索该 DOI。 如果已有条目带有相同 DOI，就找到了重复项。如果 DOI 没有匹配结果，先进行标题检查，再判断该条目是否为新条目。
- 比对标题。 在文库中搜索论文标题（包括副标题）。若标题匹配且两条记录都没有 DOI，则很可能是重复项；再核对作者和出版年份是否一致来确认。
- 运行重复检测。 Zotero 会识别可能的重复条目，并提供合并界面，在合并条目记录的同时保留分类和标签。用它并排查看这一对条目，而不是手动删除其中一条。
- 合并并保留更完整的记录。 合并界面合并记录时，保留元数据最完整版本的字段值，例如完整作者列表、卷号和页码信息以及摘要。
DOI 不一致本身并不能证明条目不同：同一篇论文可能同时有预印本 DOI 和正式发表文章 DOI。遇到这种情况应视为未解决，先比对标题、作者和年份，再决定是合并，还是保留两条记录并注明二者关系。
若想在合并前核对元数据，可通过 Crossref REST API 查询 DOI，返回该 DOI 所存缴的元数据，再与文库条目中的字段进行比对。