如何为新主题创建种子图书馆

种子图书馆是当你进入一个陌生主题、需要推进到稿件、综述、合著者交接或可复现检索时，所刻意组建的小型核心来源集合。它不是一份完成的参考文献目录。它是一组记录、检索笔记和决策，让你以及你之后的任何人都能追溯该主题是如何被框定的、哪些研究符合条件，以及为什么这个集合呈现出现在的样子。

实用的答案：从纳入标准而非一堆PDF开始，构建一个有记录的检索，将自由文本词与主题词跨多个来源结合，分阶段去重和筛选，并将结果存储在一个能让同一条目存在于多个分组而不重复的结构中。然后写下表明种子图书馆已准备好交接的检查点。

本指南提供该序列、一个实例、一份可复用清单，以及何时暂停和升级的停止规则。

种子图书馆是一个精选的起始集合加上其方法轨迹。集合保存你将在此基础上构建的记录；轨迹保存产生这些记录的检索、标准和筛选决策。Cochrane关于检索和选择研究的指南将此框定为：从纳入标准规划检索、使用多个来源、将自由文本词与主题词结合、记录过程、去重记录、分阶段筛选、链接同一研究的多份报告，以及在发表前重新运行检索。

这个框架很有用，因为它区分了人们经常混淆的两件事：来源和推理。一个下载了论文的文件夹不是种子图书馆。种子图书馆是一个文件夹加上解释它的标准、检索字符串、去重日志和筛选笔记。

它也不是最终综述。PRISMA 2020提供了报告清单、扩展说明、摘要清单，以及用于原始和更新系统综述的流程图模板，包括对检索、选择和综合方法的透明报告。种子图书馆是这些报告步骤日后所依据的基础，而不是报告本身。

在检索之前，明确你实际处于什么状态。大多数进入新主题的人属于以下几种状态之一，每种都需要不同的第一步。

• 空白探索者。 你只有一个主题短语，别无其他。你的第一个产物是一份纳入标准草案，而不是阅读清单。
• 继承文件夹者。 同事给了你一个Zotero集合或共享驱动器。你的第一步是重建其背后的标准，因为文件夹本身不携带其推理。
• 稿件修订者。 你有一份草稿，审稿人要求更广泛的覆盖。你的第一步是将草稿的引用与有记录的检索进行比较。
• 综述启动者。 你正在开始系统综述或范围综述。你的第一步是在筛选之前写下标准和检索计划。

写一句话描述你的状态，再写一句话描述你接下来必须产生的产物。这一对句子成为你方法轨迹的第一条记录。

Cochrane建议从纳入标准规划检索。这是塑造下游一切的决策，因此要明确并注明日期。

一份可行的标准笔记回答：

• 人群或研究对象。 来源必须关于什么？
• 研究或文献类型。 哪些设计或格式算数？
• 时间和语言界限。 你施加了什么限制，为什么？
• 排除项。 什么看起来相关但超出范围？

保持笔记简短到可以修订。重点不是完美的方案；而是一个你可以据此筛选并日后辩护的书面标准。当标准变化时，添加带日期的修订行，而不是覆盖原始内容。

检查点： 你可以将标准笔记交给合著者，他们能大致预测你会保留哪些论文。

Cochrane的指南很具体：使用多个来源，并将自由文本词与主题词结合。这种结合很重要，因为自由文本捕捉新表述，而主题词捕捉索引词汇。

分三层起草你的检索：

1. 概念块。 将主题分解为两到三个核心概念。
2. 每个块的同义词和变体。 包括拼写变体和相邻术语。
3. 每个块的主题词。 添加你的来源使用的受控词汇。

然后在多个来源上运行检索，并为每个来源记录确切的字符串、运行日期和使用的界面。这就是学术检索界面发挥作用的地方：使用WisPaper检索来运行和捕获你的主题检索，并将字符串保留在你的方法轨迹中，使检索可复现而非凭记忆。

如果你对主题不熟悉，在最终确定字符串之前需要方向，WisPaper学术检索入口解释了如何查找学术论文，可以帮助你了解该领域实际使用的词汇。

检查点： 每个检索字符串都写下了其来源和日期，并且至少检索了两个来源。

Cochrane建议去重记录并分阶段筛选。分阶段筛选使工作量保持诚实：你先应用宽泛标准，再应用更窄的标准。

一个实用的分阶段：

• 阶段1——标题和摘要。 应用标准笔记。为每条记录记录一个决策。
• 阶段2——全文。 确认纳入资格并记录排除原因。
• 阶段3——链接报告。 Cochrane还建议链接同一研究的多份报告，以便出现在多篇论文中的同一研究只被计数一次。

Zotero的重复条目集合支持审查和合并，这为你提供了一个在筛选前解决重复项的具体位置。记录每个阶段进入多少条记录以及排除了多少条，因为这些计数是流程图日后所需的。

检查点： 每条纳入记录都有筛选决策，如果在全文阶段被排除，则有记录的原因。

一个新主题的种子图书馆通常同时服务于多个目的：一份稿件、一个方法部分、合著者的问题和未来的综述。Zotero集合可以将一个条目组织在多个项目分组中而不重复，标签可以描述主题、方法、状态或工作流。这种组合防止种子图书馆分裂成副本。

一个遵循该指南的简单标签方案：

• 主题标签用于来源所涉及的概念块。
• 方法标签用于设计或方法。
• 状态标签用于筛选状态（例如，纳入、排除、待定）。
• 工作流标签用于来源的使用位置（稿件部分、背景、方法）。

保存的检索会自动更新，这意味着保存的查询可以作为你图书馆的活视图，而不是你必须重建的快照。

如果你想要一个与检索并存的集合工作主页，我的图书馆让你保存或上传论文并组织它们。将其与保存检索的习惯配对，使新记录无需手动重新排序即可浮现。

检查点： 没有条目存在两份副本，并且每个纳入条目至少带有主题标签和状态标签。

方法轨迹是大多数种子图书馆丢失的部分。刻意保存它：

• 带日期的标准笔记及其修订。
• 每个检索字符串及其来源和日期。
• 去重计数。
• 带原因的筛选决策。
• 判断决策的简短日志（例如，为什么纳入一篇模糊的论文）。

这条轨迹使图书馆可复现。它也是合著者接手工作而无需重新采访你所需的东西。当你需要基于已收集的论文提问时，图书馆问答让你查询上传到我的图书馆或从检索结果添加的论文，这使答案与你自己的种子集绑定，而不是与未跟踪的检索绑定。

检查点： 同事可以阅读轨迹并重新运行你的检索而无需问你一个问题。

假设一个实验室将一个新主题交给一位新来的研究人员，交付物是一个支持未来稿件和可复现检索的种子图书馆。

1. 起始状态。 新来的研究人员有一个主题短语和一个没有笔记的继承文件夹。状态：继承文件夹者。
2. 标准。 他们写一份带日期的标准笔记，命名人群、可接受的研究类型、时间界限和排除项。
3. 检索。 他们构建两个带有同义词和主题词的概念块，在两个来源中运行字符串，并记录每个字符串及其日期。
4. 去重和筛选。 他们在Zotero的重复条目集合中合并重复项，筛选标题和摘要，然后全文，并链接同一研究的多份报告。
5. 组织。 他们按主题、方法、状态和工作流为每个纳入条目打标签，并保存一个自动更新的检索。
6. 轨迹。 他们写一份一页的方法笔记，包含标准、字符串、计数和判断决策。
7. 交接。 即将离开的研究人员阅读笔记并能重新运行检索。

对于跨越文献综述和复现的更长交接，学术智能体区域支持更长的研究任务，包括文献综述、灵感和复现用例。如果交接包括复现特定论文的结果，PaperClaw支持从上传的PDF和复现说明进行研究论文复现规划。

当四个条件成立时，图书馆就绪：

• 标准足够稳定，可以据此筛选。 你不再在记录之间重写笔记。
• 检索有记录且可重复。 字符串、来源和日期已记录。
• 当前范围的筛选已完成。 每条记录都有决策。
• 轨迹独立成立。 其他人可以遵循它。

Cochrane还建议在发表前重新运行检索。将其视为一个计划好的检查点，而不是最后的匆忙：记下你将重新运行的日期，并记录变化了什么。

使用这些规则来决定何时暂停而不是推进。

• 停止并修订标准，如果超过一小部分筛选记录对你的笔记来说是模糊的。需要改进的是标准，而不是记录。
• 停止并添加来源，如果你的检索从一个概念块返回几乎为零。词汇可能错了。
• 升级给合著者，当一个判断决策会改变图书馆的范围时，例如添加你已排除的研究类型。
• 升级给方法审稿人，当你正在准备系统综述且检索或选择步骤不再符合PRISMA 2020期望你报告的内容时。
• 发表前暂停以重新运行检索，如Cochrane所建议。

WisPaper是一个AI研究助手，用于查找、筛选、组织和处理学术论文，如WisPaper主页所述。在此工作流中，它出现在特定步骤：检索论文、在图书馆中组织它们、查询收集的集合，以及支持更长的综述或复现任务。标准笔记、检索日志和筛选决策仍然是你自己的产物，WisPaper支持围绕它们的检索、组织和查询工作。

如果你从主题和约束而非固定问题开始，灵感发现接收研究主题、背景、参考文献和实验约束来生成研究想法，这可以帮助你在检索前起草标准笔记。当你准备好将工作作为项目持有时，研究项目是创建新项目的区域。