人感染病例中的新型 H5N1 血凝素变体与唾液酸苷结合是否变差?

BC24 H5N1 血凝素变体失去可检测的唾液酸苷结合,却仍能在细胞中驱动膜融合。

直接答案

是。在 2024 年不列颠哥伦比亚省一名青少年感染 H5N1 的病例(BC24)中,携带 E190D 和 Q226H 改变的血凝素在糖芯片和 ELISA 检测中对 α2,3- 和 α2,6- 连接的唾液酸苷均表现为结合严重减弱或检测不到,其受体结合位点也缺少此前研究的 H5 血凝素中可见的 N169 自身聚糖密度。然而,全长 BC24 HA 仍能在 A549 细胞中介导膜融合,只是水平低于 VN04 和 MI24 HA。

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两种检测方法给出一致的结合丧失

论文要回答的问题是:BC24 患者体内发现的 HA 变体是否仍能附着在流感病毒进入细胞所用的唾液酸受体上。两项互补的结合检测回答了这个问题:糖芯片把多种已知结构的聚糖印在点上,读取 532 nm 处扣除背景后的荧光;ELISA 则测量 450 nm 处的吸光度,反映 HA 与固定在板上的双天线 α2,3- 和 α2,6- 连接唾液酸苷(3SLN-N、3SLN3-N、6SLN-N、6SLN3-N)的结合。

比较对象很关键。在检测灵敏度范围内,VN04 HA 在 N-连接和 O-连接糖芯片上都只结合 α2,3- 连接的唾液酸苷。MI24 HA 也是如此,但对唾液酸化 Lewis X 表现出轻微偏好,这与既往报道的 clade 2.3.4.4 HA 蛋白结合范围更广一致。相比之下,BC24 HA 对芯片上任何一种 α2,3- 连接唾液酸苷或任何聚糖都没有超过五十倍背景阈值的结合信号,在 ELISA 中对四种唾液酸苷也检测不到结合。

这一结论说的是检测灵敏度,并不等于证明亲和力为零。作者指出,BC24 HA 可能以低于 ELISA 和糖芯片检测限的低亲和力结合生物学相关的唾液酸苷,并可能在融合检测中由亲合力部分补偿,也可能使用本研究中未检测的替代受体。

受体口袋失去了自身的聚糖

VN04、MI24 和 BC24 的融合前 HA 胞外域在相同条件下表达和纯化,其冷冻电镜结构提供了机制切入点。三个三聚体整体相似,BC24 对 VN04 的 RMSD 为 0.441 Å,BC24 对 MI24 为 1.095 Å;在 pH 8 条件下,融合肽如预期被包埋在螺旋 C 束中。E190D 和 Q226H 突变没有在这些残基附近或远处造成明显的结构改变。

最显著的差异出现在受体结合位点。VN04 和 MI24 HA 中可见清晰的 N169 自身聚糖密度——建模为 GlcNAc-GlcNAc-Man-Man-GlcNAc-Gal-Sia,末端连接为 α2,3 构型——而 BC24 HA 中这一密度缺失。这种自身聚糖通常占据唾液酸结合位点,并在感染过程中被宿主细胞唾液酸苷置换,因此其缺失提示对 α2,3- 连接唾液酸苷的亲和力大幅降低。

作者检查了 BC24 HA 是否只是未能在 N169 位点糖基化。三种蛋白中都能看到来自 N21、N33、N158(仅 VN04)、N169、N289 和 N483 位点 N-连接糖基化的密度,其中 N33、N169、N289 和 N483 的首段结构可以建模。由于使用同一表达系统,且 MI24 与 BC24 胞外域高度相似,作者认为口袋中缺失的密度反映的是聚糖亲和力降低,而非糖基化缺失——同时承认自身聚糖结合缺失未必影响有效的受体结合。

残基几何解释了接触的丧失

基于模型的测量指向两个突变位点。在 VN04 和 MI24 HA 中,E190 的羧基分别距 Sia-1 的 C9 羟基 2.9 和 2.8 Å,Q226 的酰胺分别距 Gal-2 的 C4 羟基 3.3 和 3.2 Å;MI24 的 Q226 酰胺还距连接 Gal-2 与 Sia-1 的糖苷键氧 3.2 Å。这些距离足以形成氢键,从而固定 α2,3- 连接的自身聚糖。

在 BC24 HA 中,由于没有配体结合,D190 的羧基比谷氨酸少一个亚甲基,其位置距 MI24 结合的 Sia-1 对齐位置 4.9 Å。H226 偏离 MI24 结合的 Gal-2 C4 羟基位置 1.1 Å,并向 C1 羧基方向移动 0.9 Å。受体结合位点的骨架本身几乎未变,结合位点残基上 VN04 与 BC24 的 RMSD 为 0.448 Å,MI24 与 BC24 为 0.378 Å。因此,这一解释针对的是侧链接触,而不是口袋形状被重塑。

单突变与双突变表现相同

ELISA 诱变实验把两个改变分开考察。以 MI24 HA 为起点,E190D 单突变、Q226H 单突变和 E190D+Q226H 双突变都表现出对 α2,3- 和 α2,6- 连接唾液酸苷的结合减弱。在 BC24 HA 上做反向实验——D190E、H226Q 和 D190E+H226Q——结果相同,而 BC24 野生型检测不到结合。

在所检测的四种代表性唾液酸苷上,每个单突变和双突变都产生相似的结合减弱表型。作者据此认为,该病例中突变病毒的受体结合并不取决于 E190D 与 Q226H 的特定组合。由于患者体内预计存在单突变群体,这一结果意味着多个病毒群体共享结合减弱表型,而不是只有一个双突变谱系。

结合弱的变体仍能融合膜

结合检测不能说明 HA 能否完成其功能。作者在 A549 肺泡癌细胞中表达全长、无标签的 BC24 HA,通过酸化触发融合,读取合胞体形成和 NanoBiT 荧光素酶信号,并在每个生物学重复内以 VN04 HA 归一化。此前已证明 A549 细胞表面同时展示 α2,3- 和 α2,6- 连接的唾液酸苷。

BC24 HA 能驱动融合,但水平低于 VN04 和 MI24 HA;三项比较相对模拟转染对照的显著性分别为 p = 1.1541×10⁻¹⁰、5.8429×10⁻⁶ 和 1.4048×10⁻⁶。BC24 HA 的融合也显著高于常用的结合缺陷 Y98F 突变体,尽管信号范围有重叠。由于已有报道 Y98F 在特定细胞类型中仍可增殖,作者认为这些结合减弱的少数变体仍具功能。

作者指出,A549 细胞不能完全模拟真实肺组织;BC24 HA 也可能以低于检测限的亲和力结合生物学相关唾液酸苷,并在融合检测中被亲合力部分补偿,或使用未检测的替代受体。

没有证据支持受体特异性转换

对人感染 H5N1 病例的一个自然假设是 HA 获得了 α2,6 偏好,因为这种连接在人上呼吸道更常见。本研究数据不支持这一点。BC24 HA 对 α2,3- 和 α2,6- 连接唾液酸苷都检测不到结合,每个突变都同时降低对两类唾液酸苷的结合,而不是以一种换另一种。作者明确表示,其发现不支持受体特异性从 α2,3- 向 α2,6- 连接唾液酸苷转换。

剩下的是一种对两种构型的经典受体结合都更差、却仍保留融合能力的变体。论文提出的解释是空间性的,而非受体驱动的:由于序列来自下呼吸道样本,作者假设结合亲和力严重降低但仍足以支持融合,可能通过帮助病毒避开远端气道中的受体诱饵或其他抑制因子,使这些变体在远端气道富集。这明确是假设,不是实测结果。

患者血清和广谱中和抗体仍能结合

受体结合减弱并不意味着免疫识别减弱。BC24 患者感染后血清在血清流感 A 检测阴性后 1 至 4 天内的四个独立时间点采样,均对 BC24 HA 及其他流感亚型 HA 蛋白显示强结合。因此,患者自身的抗体应答仍能识别该变体 HA。

靶向大多数 HA 亚型保守茎部表位的广谱中和抗体 MEDI8852 也能有效中和 BC24 HA。在 NanoBiT 荧光素酶融合检测中,VN04 HA 和 MI24 HA 的估计 IC50 分别为 25.3 nM 和 31.9 nM,BC24 的中和效果至少与两者相当。用 MEDI8852 Fab 进行的生物层干涉实验证实,三种 HA 蛋白均在纳摩尔范围内特异性结合。由于茎部表位远离受体结合位点,这些实验使用了额外携带 Y107F 突变的 HA,以降低受体结合、提高产量。

少数变体使重症图景更复杂

论文最具影响的观察在群体层面。BC24 病例中多达三分之一的序列读段携带 E190D 或 Q226H,而每个突变单独或共同都严重降低唾液酸苷结合。因此,相当一部分病毒群体携带结合减弱的 HA 表型;作者称这揭示了重症禽流感感染中可能存在的因素具有进一步复杂性。

这种复杂性说明不能仅用受体结合强弱作为重症程度的替代指标。作者对比了不同病例:此前描述的一例感染仅限于结膜炎,而 VN04 和 BC24 病例分别为致死和重症,却表现出较弱的受体结合。疾病严重程度受多种因素影响,论文把空间富集的想法作为潜在因素之一,而非已证实的病因。

这篇论文设定的实际优先事项是:把 HA 变体作为混合群体来表征,而不是只看单一共识序列,并分别检测结合与融合。一个变体可以在糖芯片和 ELISA 中对 α2,3- 和 α2,6- 连接唾液酸苷都低于检测限,却仍能在肺泡细胞中介导融合——因此,阴性结合结果应与融合能力、所检测的具体聚糖以及该变体在患者中的频率一起解读,而不能当作病毒无法进入或传播的证据。

本文引用的文献

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人感染病例中发现的新型 H5N1 流感血凝素变体唾液酸苷结合减弱

携带 E190D 和 Q226H 的 BC24 H5N1 血凝素变体失去对 α2,3- 和 α2,6- 连接唾液酸苷的可检测结合,受体结合位点也缺少 N169 自身聚糖,但全长 BC24 HA 仍能在 A549 细胞中介导膜融合,水平低于 VN04 和 MI24 HA。