感染驱动的免疫逃逸如何改变流行病模型动态?

单毒株SIRCm模型显示,感染驱动的免疫逃逸可使地方病平衡点失稳,并令流行率急剧升高。

直接答案

在带免疫衰减的SIRC模型中加入感染驱动的免疫逃逸,会带来原模型不具备的两种变化:反馈强度越过阈值后,地方病流行率会急剧上升;在传播驱动版本中,地方病平衡点还可能失稳,使流行率在没有任何季节性驱动的情况下持续振荡。

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用反馈回路替代显式毒株

这篇论文要回答的问题是:能否不追踪单个毒株,就刻画病毒突变在人群层面的效果。作者给出的答案是SIRCm模型,它扩展了SIRC(易感—感染—康复—交叉免疫)模型。在SIRC中,康复者不会直接回到完全易感状态,而是先进入交叉免疫类C;在C中再次感染的概率被因子σ削弱,之后交叉免疫消退,个体才重新完全易感。

SIRCm保留这四个仓室,但把两个转移速率乘以一个反馈项。完全免疫消退(R→C)的速率乘以(1+ε₁g(x)),交叉免疫消退(C→S)的速率乘以(1+ε₂g(x))。参数ε₁和ε₂决定当前感染水平对免疫逃逸的放大强度;两者都取零时,模型回到原来的SIRC。因此突变是隐式处理的:它只表现为个体更快地流向免疫更弱的群体,而不是作为一个新毒株出现。

论文研究了g(x)的两种取法。在传播驱动模型中g(x)=SI,突变机会在发生新感染时产生;在流行率驱动模型中g(x)=I,突变机会只与感染人群规模成正比。两者都是单毒株形式,基本再生数与SIRC相同:R₀=β/(μ+α),其中β是传播率,α是康复率。

任意反馈强度下都存在地方病平衡点

作者首先确认模型是良定的。状态空间是满足S+I+R+C=1的单纯形,论文证明它前向不变:从其中出发的解始终留在其中,且由于出生率与死亡率同为μ,总人口守恒。

核心的存在性结果借助持久性理论证明,而不是直接求解平衡点多项式。作者报告,即使把系统降维到三维四面体,用标准代数方法也无法证明根落在单纯形内。于是他们改为验证一个不动点定理的条件:流是带紧吸引子的连续半流;灭绝集前向不变;每条边界轨道都收敛到无病平衡点;当R₀>1时,该平衡点排斥感染为正的轨道。

由此得到的定理是:只要R₀>1,对任意ε₁、ε₂≥0,SIRCm都存在一个I*>0的地方病平衡点。这是一个存在性结论,并不声称该平衡点在所有情形下都稳定或唯一;稳定性另行讨论。

弱反馈回到SIRC,强反馈回到SIS

论文在反馈强度的两端给出了解析刻画。弱反馈极限下,地方病平衡点唯一且局部渐近稳定,动态接近SIRC,地方病流行率通常相当低。强反馈极限下,模型趋近经典的SIS模型,即感染不产生任何免疫。

对强反馈,作者用快慢分解找到一个吸引的局部不变流形,其慢动态正是SIS模型的动态。他们还给出递推方案,可在两种极限下以逐阶提高的精度计算地方病平衡点的渐近近似。

实际后果是转变很陡峭,而非渐变。在弱到中等反馈的较大范围内,长期感染比例I*接近其SIRC取值;一旦反馈强度越过某个阈值,I*便迅速上升,逼近其理论上限。论文报告,强反馈情形下地方病流行率通常超过总人口的50%,由“发病率越高→免疫逃逸越快→发病率更高”的回路维持。

传播驱动反馈使平衡点失稳

最具特色的结果与稳定性有关。与SIRC不同,SIRCm的地方病平衡点在某些参数区间内不稳定。对传播驱动模型,作者以反馈强度为参数,用数值延拓追踪Hopf分岔集,发现平衡点在一段有界的中间反馈强度窗口内失去稳定性。

在该窗口内,轨道趋近极限环,流行率持续振荡。论文强调,模型中没有任何随时间变化的东西:没有季节性驱动,也没有外部驱动。振荡完全由感染与突变之间的反馈回路产生。作者据此提出对反复出现的流行波的一种替代解释:通常这类流行波被归因于传播的外部季节性变化,而按本文观点,季节性行为可能主要是强化振荡的时相,而非其主要驱动因素。

失稳只限于中间区间。反馈很弱时行为类似SIRC,反馈足够强时趋近SIS式行为,因此振荡窗口位于两个极限之间,而不在任一端。

流行率驱动与传播驱动模型出现分歧

g(x)的两种取法不能互换。产生失稳窗口和持续振荡的是g(x)=SI的传播驱动模型。对流行率驱动模型,论文只关注对角线ε₁=ε₂=ε,并报告在所测试的现实参数范围内,对每个β₀和每个ε≥0,地方病平衡点都保持局部渐近稳定。

这种稳定性并不覆盖整个双参数空间。附录报告,在足够小的ε₁处存在一个不稳定区域,它紧邻对角线但不穿过对角线。因此,承载主要数值分析的对角线切片是稳定的,而更广的参数空间并非处处稳定。

这一区别对解读很关键:感染驱动的逃逸是否会使系统失稳,取决于假定突变机会如何随状态变化,而不只取决于反馈有多强。

突变反馈重塑季节性驱动下的周期

论文还在季节性驱动下比较SIRCm与SIRC,把常数传播率β₀替换为β(t)=β₀(1+ηcos(2πt))。使用两组参数:热带情形β₀=1200、η=0.07,温带情形β₀=400、η=0.18。

在热带情形,两个模型都进入稳定的年周期,SIRCm的峰值和谷值流行率都高于SIRC,这与其更高的地方病流行率一致。在温带情形,SIRC进入Casagrandi等人针对该参数设置报告的混沌吸引子,而ε̃=0.3的SIRCm收敛到周期2循环。

附录显示结果取决于反馈强度。ε̃=0.4和0.6时,温带情形可表现为规则或混沌行为;ε̃=1时,SIRCm进入规则的年周期,与混沌的SIRC基线形成对比。当ε̃从1升到10,平均流行率向ceiling I*∞=1−R₀⁻¹攀升;热带情形下振荡幅度收缩,几乎变成恒定的高流行率,而温带情形下仍保留可见的年振荡。因此突变反馈既能改变受迫动态的水平,也能改变其定性特征。

宿主人口规模可能推动这一转变

由于向高流行率的转变很陡峭,作者追问是什么决定了反馈强度。他们列出病原体的繁殖率、有益突变的概率,以及宿主人口的总体规模:宿主足够多时,免疫逃逸有可能以持续很高的速率进行。

论文也直白说明了主要理想化之处。把免疫逃逸当作发病率或流行率的线性函数过于简化,在非常大的宿主人口中可能出现某种饱和。模型还是单毒株、粗粒化的,不解析单个毒株的共存与替换;作者把它定位为介于SIRC与显式多毒株模型之间的中间方法。

因此最有用的解读以反馈强度为条件。低于阈值时,SIRCm的行为很像地方病流行率较低的SIRC;高于阈值时,流行率迅速升向SIS式的上限。传播驱动形式还多出一个独立的中间窗口,其中平衡点不稳定,振荡在没有季节性驱动的情况下出现;而流行率驱动形式在所测试的对角线上保持稳定。适用哪种情形,取决于突变机会如何随感染变化,以及包括宿主人口规模在内的、决定反馈强度的因素。

本文引用的文献

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Compartmental epidemiological models with infection-driven immune escape

SIRCm证明任意反馈强度下都存在地方病平衡点,在弱、强极限下分别回到SIRC和SIS,并表明传播驱动模型的平衡点在一段中间反馈窗口内不稳定,从而在没有季节性驱动时产生振荡。