成对，源于身体由左右镜像两侧构成
许多动物沿左右轴排布身体，因此在两侧形成的结构往往成对出现。在脊椎动物中，让动物得以游泳、行走并开拓新栖息地的成对鳍和四肢就是经典例子，它们由身体两侧特定的一层胚胎组织发育而来[2][5]。对七鳃鳗（一种无颌鱼）的研究发现，这层组织——体壁中胚层——在成对附肢出现之前就已经存在，提示成对的“原材料”先有了，附肢是后来才由它搭建起来的[5]。
遗传层面的历史还要更久远。一类名为Paired类同源盒基因的发育基因，在动物发育早期帮助设定身体格局，有着很深的演化根源[4]。这并不意味着存在某个单独的“成对基因”让一切都变成两份；它意味着，构建有格局、左右两侧身体的机制非常古老，而器官可以在这个框架内被复制，也可以被单独保留下来。
扭转和卷曲能把一对变成一个器官
成对也可以丢失。在蜗牛及其近亲中，身体在发育过程中发生扭转（这一过程称为扭转），壳也不对称地卷曲，而这种重新排布与原本成对的器官减少或丢失有关，包括鳃以及外套腔中的其他结构[1]。换句话说，同一种动物可以一开始某样东西有两个，最终实际上只剩一个，不是因为另一个没用，而是因为身体的几何形态把它挤掉了。
在所提供的这些研究中，这是说明“为什么有些成对、有些只有一个”并非固定规则的最清楚证据。器官的数量是整个身体布局的结果，而布局一变，器官数量也随之改变。
有些成对器官是为了非常特定的任务
并非每一对都是又大又显眼的器官。昆虫有小型辅助搏动器官，本质上是辅助泵，帮助把液体输送到主心脏难以充分到达的身体部位，而且这类结构在演化中多次独立出现，设计却惊人地相似[3]。它们成对出现也符合同样的逻辑：它们是安置在需要之处的局部解决方案，分布在身体两侧。
更广泛地说，成对是一种布局选择，而不是重要性的标志。一对微小的泵和一对四肢都反映了身体哪里需要功能，而当一个集中化的结构能把活儿干得更好时，单个器官就出现了。
成对四肢最初如何出现，仍是未解之谜
成对附肢的起源已经争论了150多年，包括侧褶说和鳃弓说在内的主流观点，都还没有被决定性的证据所定论[2]。七鳃鳗的研究支持了这样一种看法：成对附肢所需的组织在附肢本身出现之前就已存在，但它并没有解释为什么有些器官始终保持单个[5]。
所以，诚实的答案有两部分：大的格局——成对来自左右两侧的身体布局，而当身体扭转或特化时成对就会丢失——有充分支持；而每种成对结构具体如何一步步起源，仍在研究之中。
本文引用的文献
盾鳃目腹足类的外套器官及其在整个软体动物中的演化
腹足类的不对称壳卷曲和扭转，与原本成对的外套器官和栉鳃的减少或丢失有关。
脊椎动物演化与个体发育中的成对鳍
成对的鳍和四肢是脊椎动物的关键适应特征，但关于其起源的主流理论在150多年的争论后仍无定论。
辅助搏动器官：昆虫的演化创新
昆虫多次演化出小型成对的辅助搏动器官，即辅助循环泵，且设计几乎相同。
同源盒基因的演化：Q50 Paired样基因奠定了Paired类的基础
Paired类同源盒基因有着深远的演化根源，并在动物身体格局形成的早期发育中发挥作用。
七鳃鳗体壁的组织结构为脊椎动物成对附肢的演化提供线索
七鳃鳗胚胎具有体壁中胚层，即发育为成对附肢骨骼的组织，表明这种组织在成对附肢出现之前就已演化出来。